本应用案例由学术研究人员与 Drylab 共同创建。完整的对话过程展示了研究人员如何与 Drylab 进行交互以执行分析、提出问题，并随着新见解的涌现而调整工作流程。
我们希望这些示例能为您自己的研究带来新的方法和启示。
分析框架
独立质控（QC）过滤（nFeature, percent.mt）证实了已上传的 GEO 数据集（GSE293435）的稳健性。
Drylab 分析在不同条件（纯心肌细胞 CM-only、EPC+SB、EPC→DC）下的细胞产量方面实现了高度一致性。
高分辨率细胞类型图谱
Drylab 基于图论的聚类分析完美对应了论文中对心室、心房及增殖型心肌细胞（CMs）的鉴定。
特定条件下的心肌细胞组成
证实 EPC(+SB) 共培养物主要产生一个独特的、具有传导能力的心肌细胞亚群。
Drylab 定量分析表明，EPC→DC 共培养促使约 60% 的心肌细胞向结构重塑状态转变，验证了论文的主要表型发现。
增殖与成熟轴 (EPC+SB)
GO 富集分析证实了论文中描述的 WNT 信号通路上调是驱动增殖的因素。
确定 SOX3 和 ID3 是该增殖状态的关键转录驱动因子。
基因 | log2FC | 校正后 p 值 | % EPC(+SB) | % 纯心肌细胞 |
|---|---|---|---|---|
SOX3 | 3.75 | <0.001 | 15.5% | 1.9% |
CYP26B1 | 3.62 | <0.001 | 11.4% | 1.3% |
ID3 | 3.59 | <0.001 | 29.3% | 4.4% |
NRP2 | 3.31 | <0.001 | 11.7% | 1.6% |
DCN | 3.28 | <0.001 | 28.8% | 4.9% |
PODXL | 3.24 | <0.001 | 10.9% | 1.7% |
表：前 10 个上调基因 - EPC(+SB) 对比纯心肌细胞
电化学成熟与传导
“心脏传导”是区分纯心肌细胞与 EPC→DC 最显著的 GO 条目
心脏传导热图显示，在纯心肌细胞和 EPC+SB 中呈高表达，但在 EPC→DC 中出现下降。
基因 | log2FC | 校正后 p 值 | % EPC→DC | % EPC(+SB) |
|---|---|---|---|---|
NPPB | 4.19 | <0.001 | 82.9% | 9.9% |
PRRX1 | 3.91 | <0.001 | 29.7% | 1.6% |
KRT80 | 3.82 | <0.001 | 21.9% | 0.9% |
ANKRD1 | 3.50 | <0.001 | 83.0% | 20.0% |
SULT1E1 | 3.19 | <0.001 | 34.3% | 4.3% |
PDLIM3 | 3.06 | <0.001 | 58.6% | 7.6% |
表：前 10 个上调基因 - EPC→DC 对比 EPC(+SB)
重塑的拟时序推断
Drylab 为每个细胞分配了连续的“细胞发育时间”。EPC→DC 细胞所处的拟时序显著晚于（中位数 62.2）纯心肌细胞（24.7）。
增殖性重塑特征基因集
驱动“成熟”轨迹的主导基因实际上是 DNA 复制因子（MCM2/4/5/6、TYMS、HELLS）。
这表明 EPC→DC 状态不仅是“成熟”，而是一种增殖性重塑状态，此时肌节组装与细胞周期活动同时发生。
增殖性重塑特征基因集
基于经典的心肌细胞成熟标志物（肌节基因、离子通道、钙处理蛋白）计算了综合成熟度评分，以提供每个细胞成熟状态的简要评估。
EPC->DC 细胞的结构成熟度最低，富含因 TGF-beta 激活的心外膜信号传导所驱动的增殖、去分化心肌细胞。EPC(+SB) 部分抑制了这一增殖程序，并维持了中间水平的结构成熟度。纯心肌细胞则是结构/电生理成熟度最高的基线细胞。
